A materialidade dos recursos, a relevância dos assuntos a serem abordados e a importância socioeconômica dos órgãos, entidades e programas de governo a serem auditados deverão ser considerados para a inclusão de unidades da administração federal em planos de auditoria.

A amostragem clássica de variáveis não é uma metodologia possível de ser aplicada nos testes substantivos, uma vez que aquela tem como base a teoria da distribuição normal para avaliar a população da conta que está sendo auditada. Nessa técnica de amostragem, podem-se adotar três critérios: média por unidade, diferença e quociente.

Há uma relação direta entre os testes substantivos e os testes de observância. Quanto maior a confiança constatada nos controles internos, menor a extensão e profundidade na aplicação dos testes substantivos.

Os testes de observância visam à obtenção de razoável segurança de que os procedimentos de controle interno estabelecidos pela administração estão em efetivo funcionamento e cumprimento. Desse modo, os testes de observância fundamentam-se em amostras retiradas de uma população com a finalidade de determinar até que ponto os procedimentos de controle interno obedecem à boa prática contábil.

Os procedimentos adotados ao longo da auditoria contábil proporcionam a obtenção de evidências acerca da real situação das demonstrações contábeis das empresas. A extensão e profundidade dos procedimentos ficam a cargo do auditor responsável e, após o levantamento das evidências, o auditor apresenta sua opinião a respeito das demonstrações contábeis auditadas.

Há duas modalidades de atuação da auditoria externa governamental: auditoria de desempenho operacional e avaliação de programa. A auditoria de desempenho operacional verifica em que medida as ações implementadas lograram produzir os efeitos pretendidos pela administração e a avaliação de programa busca apurar, além da eficiência operativa, o grau de cumprimento das metas, comparando as previstas com as realizadas.

O servidor responsável pelos trabalhos de auditoria tem a obrigação de manter sigilo sobre dados e informações obtidos nos trabalhos pertinentes aos assuntos sob sua fiscalização, utilizando-os, exclusivamente, para a elaboração de pareceres e de relatórios destinados à sua chefia imediata.

Ao servidor responsável pelos trabalhos de auditoria externa será assegurada a prerrogativa de acessar todos os documentos necessários para a realização de seus trabalhos, inclusive acesso aos sistemas eletrônicos de processamento do órgão fiscalizado.

As inspeções e auditorias serão objeto de controle centralizado pela unidade técnica competente, mediante encaminhamento pelas unidades executoras de comunicação de início dos trabalhos acompanhada de cópia do programa e respectivos resultados das auditorias.

A amostragem de probabilidade proporcional ao tamanho utiliza a teoria de amostragem de atributos nos procedimentos de transações e de saldos e apresenta suas conclusões em valores monetários. Sua aplicação verifica, principalmente, se as transações e saldos estão sendo registrados de maneira superavaliada.