O desenvolvimento e a eficiência do sistema radicular das mudas são muito influenciados pela aeração do solo, que, por sua vez, depende do substrato usado.

O substrato ideal para a produção de mudas florestais deve reter baixa quantidade de água, apresentar alta densidade e possuir adequada aeração.

No caso de mudas em recipientes, o sistema radicial é envolto por um substrato composto por solo e água, ao qual não devem ser acrescentados adubos minerais, em razão da inibição causada por estes ao desenvolvimento do sistema radicular.

No Brasil, de acordo com a espécie, podem ser produzidas e comercializadas mudas com raiz nua e mudas em recipientes. As mudas com raiz nua são produzidas mediante semeadura em canteiros, não possuindo proteção do sistema radicular no momento do plantio.

O viveiro deve ser instalado em local com pouca incidência direta de luz solar, uma vez que a luz solar pode produzir queimaduras nas mudas jovens, dificultando o seu desenvolvimento.

A declividade mínima da área onde será implantado o viveiro deve ser de 25%, para possibilitar um adequado escoamento de água pluviais

O viveiro deve ser localizado o mais próximo possível em relação à área de plantio das mudas, com estradas de fácil acesso, mesmo em época de chuvas.

O incêndio em uma mata favorece a regeneração natural das espécies de valor comercial, favorecendo assim a capacidade produtiva da floresta.

As áreas de matas exploradas e capoeiras geralmente são mais resistentes à ação do fogo, pois nesses locais as chuvas chegam com maior facilidade ao solo, mantendo-o úmido, o que dificulta o espalhamento do fogo em caso de incêndio.