Dentre os diversos vírus responsáveis pela rinofaringite, os mais frequentes são o rinovírus, coronavírus, vírus sincicial respiratório (VCR), influenza, parainfluenza, coxsackie e adenovírus.

A rinofaringite engloba quadros como o do resfriado comum e a rinite viral aguda. Embora seja causada também por bactérias e fungos, além dos vírus, é a IVAS mais comum na infância.

Podem ocorrer complicações bacterianas durante quadros de infecções respiratórias virais. Persistência de febre por mais de 72 horas ou prostração mais acentuada são sugestivas dessas complicações, sendo as mais frequentes a otite média aguda e a sinusite.

Como podem ocorrer manifestações iniciais comuns a outras doenças, os principais diagnósticos diferenciais são sarampo, coqueluche, infecção meningocócica ou gonocócica, faringite estreptocócica, hepatite A e mononucleose infecciosa.