Em portadores assintomáticos com um perfil de anticorpos de alto risco, o tratamento profilático com AAS em baixa dose (75-100 mg, diariamente) é recomendado somente se os fatores de risco forem tradicionais.

Em pacientes com síndrome do anticorpo antifosfolípide definida, diante de primeira trombose venosa não provocada, o tratamento com varfarina é recomendado, com alvo de INR entre 2–3 por curtos períodos.

Os anticoagulantes orais diretos podem ser considerados em pacientes que não são capazes de atingir um INR-alvo, apesar de terem boa adesão à varfarina, ou em pacientes com contraindicações à varfarina.

De acordo com as diretrizes internacionais, em pacientes com primeira trombose venosa provocada, a terapia deve ser continuada por um período de tempo indeterminado, o que difere da terapia para pacientes sem síndrome do anticorpo antifosfolípide.

Em pacientes com doença diagnosticada e trombose venosa recorrente, a despeito da indicação do uso de varfarina, não se deve investigar a adesão ao tratamento, juntamente com os testes de INR frequentes; ao contrário, é necessário se considerar a realização de antiplaquetários.