Dentro do ambiente escolar, o profissional é capacitado a interagir com todos os níveis de ensino, desde a Educação Infantil até o Ensino Superior. Nesse caso, o educador físico faz o planejamento, a avaliação e a implementação de programas da matriz curricular de Educação Física.

A prática pedagógica do professor de Educação Física na escola deve, além das vivencias físico-motoras, promover uma ação dialógica-crítica que ajude na ampliação da visão de mundo das crianças, dando a elas ferramentas necessárias para que, enquanto cidadãs, possam ser agente resistência e transformações na sociedade.

O papel do profissional de educação física nas escolas se restringe às práticas que promovem a saúde. Esse profissional não é responsável por ampliar a responsabilidade da educação para as habilidades sociais e psicológicas, nem priorizando a afetividade, o equilíbrio e a boa convivência dos alunos na escola e na sociedade.

No âmbito escolar, a Educação Física busca despertar o interesse e envolver os alunos em exercícios e atividades corporais, desenvolvendo convivência harmoniosa e construtiva com outros cidadãos. Assim, eles se tornam capazes de identificar e respeitar o próprio desempenho e características físicas, além da individualidade dos colegas, sem segregar nem depreciar outras pessoas por peculiaridades e qualidades como aspectos sociais, físicos ou sexuais.