As áreas-núcleo não possuem limites rígidos, e o processo de ocupação e o manejo dos recursos naturais são planejados e conduzidos de modo participativo e em bases sustentáveis.

Nas zonas de amortecimento, somente são admitidas atividades que não resultem em dano para as áreas-núcleo.

As zonas de transição destinam-se à proteção integral da natureza.

As áreas só podem ser de domínio público.

A gestão é feita por um Conselho Deliberativo, formado por representantes somente de instituições públicas e de organizações da sociedade civil.