Compete à Seção de Epidemiologia e Análise de Risco, dentre outras atribuições, organizar e executar as atividades relativas à defesa sanitária animal, conforme legislação pertinente.

À Seção de Epidemiologia e Análise de Risco compete, dentre outras atribuições, promover e supervisionar a execução das atividades de inspeção dos estabelecimentos de abate e estocagem de carnes, da indústria de produtos e subprodutos de origem animal e de seus derivados de valor econômico, sob os aspectos higiênico-sanitários e tecnológicos.

À Seção de Epidemiologia e Análise de Risco compete, dentre outras atribuições, avaliar qualitativamente a ocorrência de doenças em populações animais.

Compete à Seção de Epidemiologia e Análise de Risco, dentre outras atribuições, promover a implantação, registro, funcionamento, inspeção e fiscalização de estabelecimentos em propriedades rurais destinados à industrialização de produtos de origem animal por processo artesanal.

À Seção de Epidemiologia e Análise de Risco compete analisar e inspecionar sob os aspectos tecnológico e higiênico-sanitário projetos e memoriais descritivos de estabelecimentos industriais a serem registrados no IDAF.