Entre os nutrientes específicos utilizados no tratamento das Doenças Inflamatórias Intestinais, destacam-se os probióticos que produzem efeitos benéficos na imunidade intestinal.

Na doença de Crohn, a ingestão de gordura pode ser reduzida se houver esteatorreia. O uso de triglicerídeos de cadeia média pode ser bem tolerado.

Entre as recomendações dietéticas para o tratamento da Doença do Refluxo Gastroesofágico deve-se evitar alimentos que aumentam a pressão do esfíncter esofágico inferior, como chocolate, cebola, alho, hortelã.

Para a prevenção e no tratamento da constipação intestinal, as fibras insolúveis em água devem estar mais presentes em relação às solúveis.

A lesão na mucosa intestinal, presente na diarreia persistente, pode provocar uma deficiência de lactase impossibilitando a hidrólise da lactose.