A cor na água pode ser resultado da presença de compostos de cloreto de sódio ou do lançamento de diversos tipos de resíduos industriais.

A cor da água é produzida pela reflexão da luz em partículas minúsculas, denominadas coloides, finamente dispersas e de origem predominantemente orgânica.

Os compostos orgânicos que conferem cor às águas naturais são provenientes da decomposição de matéria inorgânica de origem vegetal e do metabolismo de microrganismos presentes no solo.

Atividades antrópicas, tais como descargas de efluentes domésticos ou industriais, lixiviação de vias urbanas e solos agricultáveis não possuem relação com a presença de cor nas águas naturais.

Quando a cor se manifesta em águas subterrâneas, geralmente é resultado da presença de depósitos de cálcio.