Ambas as doenças apresentam maior incidência entre os 20 e 30 anos, acometem indivíduos de ambos os sexos, com predomínio, no sexo feminino, da DC sobre a RCUI.

A presença de pANCA positivo e ASCA negativo é mais sensível e específica da RCUI, enquanto pANCA negativo e ASCA positivo são achados característicos da DC.

A RCUI é também conhecida como ileíte regional e acomete parte ou todo o segmento do cólon, enquanto a DC pode ocorrer em qualquer parte do tubo digestório, desde a boca até o ânus.

Por ser mais prevalente na região do retossigmoide, é comum na RCUI o aparecimento de fissuras e fístulas anais, fato raro na DC, na qual os abscessos perianais são complicações frequentes.

A histopatologia característica da DC é o achado de reação inflamatória não caseosa restrito à região de mucosa e submucosa, enquanto os achados na RCUI são de abscessos de cripta, que podem envolver de modo transmural o órgão.