É um dos órgãos de assessoramento diretamente vinculados à Presidência, o colégio de diretores.

Nas ausências e impedimentos, o Presidente será substituído pelo Vice Presidente.

Cada uma das Diretorias que compõem a EBSERH elaborará e aprovará seu regulamento e organograma funcional.

Compete à Consultoria Jurídica da EBSERH submeter ao Presidente, para aprovação pela Diretoria Executiva, o regulamento com o detalhamento das atribuições e o organograma da Consultoria Jurídica.

Compete à Coordenadoria de Gestão Integrada definir diretrizes, em parceria com a presidência, para a gestão estratégica institucional.