Encontra-se certa confusão entre os conceitos de fiscalização com o de controle. As interpretações equivocadas podem resultar em interpretações distintas às originalmente pretendidas pelo legislador.

O controle tem conteúdo sociológico, onde os cidadãos exercem coerção sobre autoridades, devendo estas orientarem as ações do poder administrativo de acordo com o ambiente social.

Ao mencionar o conceito de fiscalização, a Constituição empresta-lhe um significado técnico, não político. Fiscalizar implica atividade contábil, financeira, de caráter operacional e patrimonial.

Controlar pressupõe a definição da ação a ser feita e encerra um componente indefinido vinculado a manifestação popular. Controlar é o gênero fiscalizar é a espécie.

O controle interno consiste em uma estrutura montada em um órgão público, dotada de pessoas capacitadas e designadas, para a tarefa de efetuar o controle dos atos administrativos.