O sistema HLA está localizado no cromossomo humano número doze, tendo o padrão de herança dominante do HLA.

Na reação em cadeia da polimerase (PCR), utilizam-se, como molde de sequência alvo, a enzima RNA polimerase e uma sonda de DNA.

A reação em cadeia da polimerase (PCR) é uma técnica de biologia molecular utilizada para amplificar uma única ou poucas cópias de um pedaço de DNA e baseia-se no processo de transcrição do DNA que ocorre in vivo.

No estudo de paternidade por DNA, podem-se usar microssatélites para análise, os quais geralmente consistem de 1 a 6 nucleotídeos repetidos em tandem.

O sistema HLA é transmitido hereditariamente para os dois sexos indistintamente e apresenta genes recessivos e dominantes, sendo possível a combinação de genes com genótipos ou fenótipos intermediários.