Os MDL são considerados uma excelente aplicação, na conservação de florestas, já que permitem que os países do anexo 1 invistam nas florestas naturais restantes.

Os MDL, aplicados aos projetos de conservação de florestas, garantem um retorno pequeno em emissões, mas, dependendo da disponibilidade de opções, pode valer a pena para os países do anexo A.

Nem todos os projetos de conservação de florestas podem ter aplicações dos MDL, já que as florestas devem ter garantias de que possuem vegetação primária, sendo algo difícil de provar.

O mercado de MDL não pode ser considerado para os projetos de conservação florestal, já que o Protocolo de Kyoto não admite seu uso para fins de estocagem de carbono.