O tipo C da Classificação estabelecida por Gross em 1953 é o mais comum, representando até 85% dos casos.

A doença do refluxo gastresofágico é bastante comum em pacientes submetidos ao tratamento cirúrgico da atresia de esôfago e pode se manifestar clinicamente por sintomas respiratórios, vômitos e déficit de crescimento. Além disso, a presença de refluxo gastresofágico pode dificultar o tratamento endoscópico em pacientes com estenoses esofágicas na região da anastomose.

A presença de outras anomalias congênitas associadas pode causar grande impacto no tratamento e sobrevida dos pacientes com atresia de esôfago. As malformações do sistema cardiovascular são as mais comuns (23% dos casos), com destaque para os defeitos de septo ventricular e a Tetralogia de Fallot.

A atresia de esôfago sem fístula (tipo A de Gross) representa o tipo mais raro e é considerado como o de pior prognóstico devido a maior distância entre os cotos.

São fatores que podem contribuir para deiscências e fístulas da anastomose no tratamento cirúrgico da atresia de esôfago: grau de tensão e de isquemia sobre a anastomose, infecção e falhas técnicas.