A análise do ciclo celular pode ser realizada de maneira bastante satisfatória por citometria de fluxo. Uma metodologia interessante é a dupla marcação de células com iodeto de propídeo (PI) e anticorpo anti-BrDU (anti-BrDU) em células que proliferaram na presença de BrDU. Essa dupla marcação, para a maioria das células em proliferação, gera um gráfico com três regiões claramente definidas, como mostrado na figura a seguir:

As regiões destacadas na figura denotam três fases do ciclo celular: a fase G0/G1, a fase S e a fase G2/M. Essas três fases estão representadas no gráfico, respectivamente, pelas regiões: