Segundo o princípio da transdisciplinaridade, ocupa-se inicialmente com um objeto específico de estudo; e, depois, diferentes disciplinas se reúnem para elaborar um quadro final do referido princípio.

A agroecologia, cuja origem está ligada à ciência como método, tem um princípio fundamentado nas ideias do movimento positivismo-reducionista.

A agroecologia considera o desenvolvimento da agricultura e dos agricultores com base na difusão de tecnologias cientificamente produzidas para alcançar as exigências do mercado.

A agroecologia busca uma agricultura moderna e fundamentada em bases tecnológicas que, utilizando engenharia genética, tenham melhorado as variedades existentes.

A agroecologia, buscando alternativas para a atual crise da agricultura, adota a gestão ecológica dos recursos naturais por meio de formas de ação social coletiva.