Infecções são causadas pela ingestão de microrganismos patogênicos, denominados invasivos, com capacidade de penetrar e invadir tecidos, originando quadro clínico característico.

Toxinfecções são causadas por microrganismos toxigênicos, cujo quadro clínico é provocado por toxinas liberadas quando estes se multiplicam, esporulam ou sofrem lise na luz intestinal. Essas toxinas atuam nos mecanismos de secreção/absorção da mucosa do intestino.

As infecções por Escherichia coli enterotoxigênica, Vibrio cholerae, Clostridium perfringens e Bacillus cereus (cepa diarréica) são exemplos de agentes infecciosos.

Intoxicações não bacterianas são aquelas quando outros agentes não bacterianos estão envolvidos com DTAs, como nas intoxicações por metais pesados, agrotóxicos, fungos, plantas e animais tóxicos como alguns moluscos e peixes.