O kernel do MS Windows 2000 é uma estrutura de microkernel modificada, onde algumas funções de fora do kernel são executadas em modo kernel, por questões de performance.

O kernel do MS Windows 2000 é uma estrutura monolítica, onde todos os módulos estão no mesmo nível e compartilham os mesmos recursos.

O kernel do MS Windows 2000 possui uma estrutura de camadas, que permite executar aplicativos DOS, Win32 e POSIX, com o mesmo nível de acesso aos recursos do Sistema Operacional; esses subsistemas são executados no modo kernel.

O kernel do MS-Windows 2000 é um sistema em camadas, distribuídas em: HAL (Hardware Abstraction Layer), Serviços, Cache Manager, Virtual Memory Manager e subsistemas.

O MS-Windows 2000 possui o “System Call Interface”; essa interface é gerenciada pelo comando ipcs, que realiza as chamadas do subsistema de controle de processos e do subsistema de arquivos.