A caracterização de proteínas e de misturas proteicas ganhou impulso a partir dos anos 90 com o estabelecimento de novas metodologias de ionização de peptídeos e proteínas, especialmente a ionização por MALDI (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization) e ESI (Electrospray Ionization). A análise do proteoma de células, tecidos e órgãos também se tornou possível através das técnicas de proteômica. Uma das enzimas mais utilizadas para obtenção de peptídeos é a tripsina. Sobre as vantagens do uso desta enzima para as análises por espectrômetros de massas, pode-se afirmar que a tripsina: