É indicada a suplementação de prebióticos em lactentes não amamentados exclusivamente ao seio para a prevenção de doenças alérgicas e alergia alimentar.

Na alergia alimentar, deve-se excluir os alérgenos alimentares responsáveis pela reação alérgica com substituição apropriada e utilizar fórmulas ou dietas hipoalergênicas, em lactentes com alergia à proteína do leite de vaca.

Os alimentos que devem ser eliminados e posteriormente testados por meio de teste de provocação oral são os apontados pela história do paciente, no registro alimentar acoplado ou não ao diário, onde a família anota manifestações associadas à ingestão/exposição a determinado alimento.

Lactentes com alergia à proteína do leite de vaca não devem ser mantidos com fórmulas com proteína do leite de vaca, mesmo que extensamente hidrolisadas.