Baixa eficácia no controle da multiplicação bacteriana em crianças, quando comparado a outros fármacos.

Risco de toxicidade hepática mais elevado em crianças pequenas, dificultando o monitoramento laboratorial.

Maior risco de neurite óptica, com dificuldade de detecção precoce de alterações visuais nessa faixa etária.

Ineficácia na penetração em tecidos extrapulmonares, como meninges, limitando seu uso em formas graves da doença.

Falta de estudos clínicos que comprovem a segurança do uso do etambutol em menores de 5 anos.