Algumas fórmulas sofrem modificações que as afastam da composição do leite materno para ajustar sua composição a situações clínicas e necessidades nutricionais específicas, como na prematuridade.

Lactentes saudáveis e com trato gastrointestinal íntegro devem receber fórmulas com proteína intacta.

A lactose presente nas fórmulas infantis tem importante efeito bifidogênico e é um facilitador da absorção de cálcio no trato gastrointestinal.

Apesar de o leite materno conter concentrações adequadas de vitamina K e vitamina D, ainda assim é indicado uso de vitamina K profilática ao nascer.

A especificidade dos anticorpos iga no leite humano é um reflexo dos antígenos entéricos e respiratórios da mãe, o que proporciona proteção à criança contra os agentes infecciosos prevalentes no meio em que ela está inserida.