Ao Norte, o rio Oiapoque faz fronteira com a Guiana Francesa.

No centro do estado, destaca-se o rio Araguari, o maior rio estadual (nasce e deságua em território amapaense).

A Sudeste, localiza-se o maior rio do mundo em volume de água, o rio Amazonas. A capital Macapá está localizada às suas margens.

Ao Sul do estado, na divisa com o estado do Pará, há o rio Jari, com afloramentos rochosos.

O menor rio do estado, em extensão, é o rio Amapari, que percorre 344,948 Km de sua nascente até sua foz.