Recém-nascidos sintomáticos, ao nascer com citomegalovirose congênita, apresentam bom prognóstico e não têm risco de sequelas neurológicas ou surdez neurossensorial; portanto, não é necessário nenhum tratamento antiviral.

Recém-nascidos sintomáticos, ao nascer com citomegalovirose congênita, apresentam mau prognóstico; cerca de 90% podem evoluir com sequelas neurológicas e 50 a 70% com surdez neurossensorial bilateral e profunda; o tratamento, mesmo precoce, não pode evitar estas sequelas.

A letalidade nos recém-nascidos sintomáticos com acometimento sistêmico grave no período neonatal pode variar de 5 a 10%. Não há benefício no tratamento precoce com antivirais; deve ser controlada o quadro séptico com antibioticoterapia e após a alta, o tratamento antiviral pode ser iniciado.

O recém-nascido deve receber tratamento com ganciclovir durante 6 semanas, na dose de 8 a 12 mg/kg/dia, uma vez que apresenta um quadro de síndrome sepsis-like viral e pneumonite, não sendo necessário excluir outras etiologias de infecção congênita.

O objetivo do tratamento antiviral da citomegalovirose congênita a curto prazo é a melhora do quadro de sepsis-like viral, pneumonite e trombocitopenia grave refratária e a longo prazo seria a estabilização ou melhora do prognóstico auditivo ao longo dos anos. Deve ser iniciado no período neonatal.