O momento em que o Protocolo efetua a análise do documento com vistas a identificar o seu assunto, utilizando para isso o Código de Classificação de Documentos de Arquivo, é denominado controle de tramitação.

Expedição é a atividade do setor de protocolo que tem por objetivo fazer a distribuição e a redistribuição dos documentos internos e externos que tramitam na instituição.

A ação pela qual um documento passa a constituir um processo é denominada classificação, a qual visa dar forma processual aos documentos que necessitam de análise, informações e decisões.

O Protocolo deve fazer o controle da tramitação dos documentos, por meio de sistema manual ou informatizado, no sentido de identificar os departamentos pelos quais passam os documentos.

De modo geral, as atividades de protocolo são realizadas obedecendo à seguinte ordem: recebimento, registro, autuação, distribuição, classificação, expedição e controle da tramitação.