seu órgão superior é formado pelos Institutos Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis e Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade, que têm de executarem a política e as diretrizes governamentais fixadas para o meio ambiente.

o Instituto Chico Mendes de Conservação é um órgão consultivo e deliberativo do referido sistema, tendo a finalidade de assessorar, estudar e propor ao Conselho de Governo, diretrizes de políticas governamentais para o meio ambiente.

o Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis é um órgão consultivo e deliberativo do referido sistema, tendo a finalidade de assessorar, estudar e propor ao Conselho de Governo, diretrizes de políticas governamentais para o meio ambiente.

o Conselho de Governo é o órgão central desse sistema, tendo a função de assessorar o Presidente da República na formulação da política nacional para o meio ambiente e os recursos ambientais.

o Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis e o Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade, como órgãos executores do sistema, têm a finalidade de executar e fazer executar a política e as diretrizes governamentais fixadas para o meio ambiente, de acordo com as respectivas competências.