Na ionização por electrospray, as espécies moleculares são fragmentadas em função da colisão com elétrons provenientes de um eletrodo de descarga.

Analisadores de massa de duplo setor (magnético/eletrostático) possuem resoluções típicas (m/Δm) de aproximadamente 500, ou seja, possuem baixa resolução, sendo apenas capazes de separar espécies com diferença de uma unidade de massa atômica.

A espectrometria de massas é tipicamente empregada para a análise quantitativa de compostos orgânicos, sendo impossível a aplicação à análise elementar.

Em analisadores de massa por tempo de voo, diferentes íons com aproximadamente a mesma energia cinética são injetados em um tubo, sob vácuo. Íons mais leves percorrem o tubo de voo do analisador em menos tempo.

No analisador de massas quadrupolar, a combinação de potenciais de corrente direta e de radiofrequência a barras metálicas posicionadas paralelamente umas às outras promove a ionização do analito e sua fragmentação, permitindo a posterior separação em células de reação.