A competência técnico-profissional do auditor interno exige manter-se atualizado primordialmente sobre as Normas Brasileiras de Contabilidade, sendo secundário o conhecimento da legislação aplicável à entidade ou de conceitos e técnicas administrativas, e sua autonomia profissional pode ser flexibilizada dependendo de sua posição funcional na organização.

O relatório da Auditoria Interna, documento que expressa o resultado dos trabalhos, deve focar exclusivamente nos fatos constatados e nas evidências encontradas, sendo opcional incluir a metodologia adotada, as limitações ao alcance dos procedimentos ou os riscos associados aos fatos, e sua confidencialidade deve ser mantida apenas durante a vigência do contrato do auditor.

O planejamento das atividades da Auditoria Interna deve considerar fatores pertinentes, tais como o conhecimento aprofundado das atividades operacionais e financeiras da entidade, bem como o nível de confiabilidade dos sistemas de controle interno.

Os papéis de trabalho, obrigatoriamente elaborados em meio eletrônico, constituem principalmente um guia para a execução dos procedimentos.

Ao lidar com fraude e erro, a Auditoria Interna tem como principal objetivo detectar as irregularidades, devendo confirmar a sua ocorrência e reportá-las imediatamente à alta administração por comunicação verbal, focando nos erros que, por serem atos intencionais de omissão ou manipulação de transações, apresentam maior chance de dano grave.