Os órgãos superiores são subordinados diretamente aos órgãos independentes, possuem ampla autonomia administrativa, financeira e técnica, o que os caracteriza como órgãos diretivos, com funções de planejamento, supervisão, coordenação e controle das atividades de sua área de competência.

Os órgãos subalternos são os que possuem atribuições de direção, controle e decisão, mas que sempre estão sujeitos ao controle hierárquico de uma chefia mais alta e não possuem autonomia administrativa nem financeira.

Os órgãos independentes são originários diretamente da Constituição e não sofrem subordinação hierárquica de outros órgãos, sendo apenas controlados uns pelos outros, representando então, a cúpula da Administração Pública. Parte da doutrina defende que esses órgãos possuem personalidade judiciária, pois existe a possibilidade de possuírem capacidade processual.

Os órgãos autônomos são subordinados a todos os outros órgãos, possuem pequeno poder decisório e exercem basicamente funções de execução rotineiras e de atendimento aos usuários.