Um dos principais tipos de reações do sistema imunológico inato é a inflamação, que consiste no acúmulo e na ativação de leucócitos e proteínas plasmáticas em locais de infecção ou lesão tecidual.

A imunidade humoral e a imunidade celular, tipos de imunidade inata, são mediadas por células e moléculas diferentes e fornecem a defesa contra micro-organismos extra e intracelulares, respectivamente.

O sistema imunológico inato normalmente responde da mesma maneira em encontros subsequentes com um patógeno, enquanto o sistema imunológico adquirido responde de maneira mais eficaz a cada encontro sucessivo com um patógeno.

A defesa imunológica inata contra vírus intracelulares é mediada principalmente por células natural killer, que matam células infectadas por vírus, e por citocinas chamadas interferons tipo I, que bloqueiam a replicação viral dentro das células do hospedeiro.