Nas formas adquiridas, o hipogonadismo hipogonadotrófico (HH), é frequentemente determinado pela presença de lesões tumorais na região hipotálamo-hipofisária ou do tratamento dessas pela cirurgia e/ou radioterapia.

Na infância, a baixa estatura por deficiência de hormônio de crescimento (DGH) pode ser a única manifestação clínica, mesmo quando associada a outras deficiências hormonais menos evidentes, como o hipotireoidismo central ou o hipogonadismo hipogonadotrófico, cujo diagnóstico, na ausência de micropênis ou criptorquidia, não pode ser estabelecido antes da puberdade.

Embora, na mulher, um dos sintomas clínicos mais frequentes do HH seja amenorreia, a dosagem de estradiol é um dado bem mais confiável para o diagnóstico de HH.

Quando o hipogonadismo hipogonadotrófico (HH) é decorrente de hiperprolactinemia causada por um adenoma hipofisário produtor de prolactina, geralmente, a reposição hormonal é desnecessária, e o HH tende a reverter com a correção do distúrbio causador.

Nos homens, o diagnóstico laboratorial de HH é estabelecido pela dosagem de testosterona, LH e FSH.