Pacientes submetidos a transplante lamelar posterior de córnea não apresentam rejeição endotelial.

Opacidades corneanas congênitas são contraindicações absolutas ao transplante de córnea devido ao elevado risco de rejeição em pacientes pediátricos.

O glaucoma pós transplante de córnea é uma complicação possível e relativamente frequente, podendo levar à perda do botão doador e à cegueira.

O exame de histocompatibilidade do doador e receptor previamente ao transplante de córnea é sempre exigido a fim de reduzir o risco de rejeição e falência do botão doador.

Todos os pacientes com ceratocone serão em algum momento submetidos a um transplante de córnea, lamelar ou penetrante.