As metas fundamentais do REUNI para a Educação Superior se estruturam nos seguintes eixos: aprimoramento da capacidade instalada da infraestrutura; o aumento do índice de conclusão média dos cursos para 90%; o aumento significativo da relação professor/aluno; e a efetivação de estratégias de aproveitamento de créditos e de inovações acadêmicas.

As metas da expansão da Educação Superior no novo Plano Nacional de Educação (PNE) Lei 13.005/14), que coadunam com as metas do REUNI (Decreto nº 6.096/2007), são confirmadas como uma política de governo.

O REUNI introduziu o contrato de gestão nas Instituições Federais de Ensino Superior, ferindo a autonomia universitária e apostou em uma expansão sem qualidade, em um contexto de precarização do trabalho docente.

O REUNI tem como objetivo criar condições para a ampliação do acesso e permanência na educação superior, no nível de graduação, pelo melhor aproveitamento da estrutura física e de recursos humanos existentes nas universidades federais.