O setor de protocolo atua no registro inicial, mas não participa das etapas posteriores de movimentação dos documentos.

Compete ao protocolo a guarda de documentos em arquivos intermediários, inclusive para fins de preservação permanente.

A tramitação envolve o registro de entrada e saída, bem como o controle dos encaminhamentos aos setores competentes.

O protocolo é responsável somente pelos documentos classificados como sigilosos, conforme normas de segurança da informação.

A função essencial do protocolo é voltada para o registro de documentos expedidos, sendo o recebimento responsabilidade de outros setores.