Em 1857, a igreja luterana na França enviou dois pastores para a colônia que o francês Villegaignon havia fundado no Rio de Janeiro.

Após a tentativa fracassada de Villegaignon, foram os metodistas norte-americanos que se infiltraram no Brasil depois da abertura dos portos, quando Portugal firmou um tratado comercial com os americanos.

A posição política de Dom Pedro II favorável ao clericalismo dificultou as iniciativas das missões protestantes estrangeiras, de modo que imigrantes dos países protestantes não foram atraídos para o Brasil.

O mais notável missionário protestante que viveu na época de Dom Pedro lI foi o médico escocês A. G. Simonton; sua notabilidade se deu em razão de ter estabelecido boas relações com o Imperador.

Foi no Brasil que aconteceu a primeira tentativa, por parte dos protestantes, de se estabelecerem no que hoje é a América Latina.