Uma das principais características dos SAFs é o uso do componente arbóreo em sistemas agrícolas. Esse componente é usado como referencial para a classificação dos sistemas.

As sementes de espécies florestais são fotoblásticas positivas, ou seja, requerem o estímulo da luminosidade para germinar.

No embrião maduro, a parte do tecido meristemático permanece em reserva no ápice do eixo, entre os dois cotilédones.

Sementes de angiospermas são normalmente constituídas por embrião, tecido de reserva (que pode ter origem embrionária ou extra-embrionária) e tegumento(s).

Sementes desprovidas de cotilédones são corretamente denominadas sementes exalbuminosas.

As endomicorrizas, que podem ser identificadas a olho nu, formam um manto espesso de cor branca brilhante ao redor das raízes durante o desenvolvimento das mudas.

bactérias e o sistema radicular das plantas, têm sido bastante utilizadas na produção de mudas de espécies florestais no Brasil.

O desenvolvimento e a eficiência do sistema radicular das mudas são muito influenciados pela aeração do solo, que, por sua vez, depende do substrato usado.

O substrato ideal para a produção de mudas florestais deve reter baixa quantidade de água, apresentar alta densidade e possuir adequada aeração.

No caso de mudas em recipientes, o sistema radicial é envolto por um substrato composto por solo e água, ao qual não devem ser acrescentados adubos minerais, em razão da inibição causada por estes ao desenvolvimento do sistema radicular.