As contas nacionais das empresas supranacionais estão sujeitas ao controle governamental, mesmo quando a participação brasileira é minoritária.

Quando houver utilização de recursos externos, e os registros e a documentação do órgão examinado não forem considerados suficientes e adequados, a unidade de controle interno emitirá circunstanciado relatório justificando a expedição de certificado de irregularidade.

Os servidores designados para a realização dos trabalhos de auditoria não poderão, durante os trabalhos de campo, dar conhecimento das ocorrências identificadas aos responsáveis pelas áreas auditadas, devendo comunicar previamente às autoridades superiores quaisquer indícios ou suspeitas de irregularidades.

No apoio ao controle externo, os órgãos de controle interno do Poder Judiciário devem alertar a autoridade administrativa competente para que instaure tomada de contas especial, se tomarem conhecimento de prática de ato antieconômico de que resulte dano ao erário.

O Tribunal de Contas da União é competente para realizar auditoria de natureza operacional em qualquer unidade administrativa do Poder Judiciário, por iniciativa de comissão técnica da Câmara dos Deputados ou do Senado Federal.

O auditor interno deverá mencionar obrigatoriamente fatos que lhe cheguem ao conhecimento e que considere em condições de provocar efeito sobre demonstrações contábeis objeto de seu trabalho, respeitado o dever de guardar sigilo sobre o que souber em razão do exercício profissional lícito.

É vedado ao auditor, no desempenho de suas funções, emitir referência que identifique o empregador, o que configura quebra de sigilo profissional, exceto em publicação em que haja menção a trabalho que tenha realizado ou orientado, independentemente de autorização prévia.

Caso a auditoria interna, durante a realização de seus trabalhos, constate que estão ocorrendo fraudes por descumprimento de normas legais em determinada área, deverá comunicá-las imediatamente à administração da entidade, por escrito e de forma reservada.

É da competência da direção da entidade definir a natureza, a extensão, a profundidade e a oportunidade dos trabalhos a serem realizados pela auditoria, de acordo com os objetivos e diretrizes previamente estabelecidos.

Os papéis de trabalho dos auditores internos são aqueles elaborados com vistas a evidenciarem, perante a auditoria independente, a adequação e a suficiência das tarefas realizadas e a avaliação das recomendações formuladas.