Durante uma análise de dados de RNA-seq, um(a) pesquisador(a) está interessado(a) em identificar genes diferencialmente expressos entre dois grupos de amostras.

Qual algoritmo é o mais correto para executar essa tarefa?

Para a análise de dados genômicos, deseja-se utilizar um algoritmo de montagem de novo, que possa lidar eficientemente com sequências de alta cobertura e gerar contigs de alta qualidade. É o algoritmo que atinge esse objetivo e é o mais utilizado:

Um(a) pesquisador(a) está utilizando algoritmos de alinhamento de sequência para comparar genomas humanos com os de outras espécies próximas, buscando identificar regiões conservadas e divergentes. Essa análise requer o alinhamento simultâneo de múltiplas sequências para obter um panorama evolutivo completo.

O algoritmo mais correto e adequado para essa tarefa, considerando-se a necessidade de alinhar múltiplas sequências simultaneamente, é:

No contexto da edição gênica em células eucarióticas, diferentes técnicas podem ser empregadas para modificar o genoma de forma precisa. Um dos métodos amplamente utilizados para realizar edição específica de DNA em células eucarióticas é a técnica CRISPR-Cas9. Qual das seguintes opções contém corretamente um componente essencial dessa técnica?

Um(a) pesquisador(a) estuda dados de expressão gênica para analisar as vias metabólicas em células tumorais. Para garantir a confiabilidade dos resultados, decide aplicar uma técnica estatística que considera tanto as variáveis observadas quanto as ocultas. A técnica escolhida é:

Um(a) pesquisador(a) está analisando dados genômicos para identificar variações associadas a uma doença complexa. Para aumentar a precisão das suas conclusões, decide aplicar um método estatístico robusto para controle de falsos positivos. Qual dos seguintes métodos atinge esse propósito?

Uma análise genômica de dados de sequências de DNA e RNA de humanos disponíveis em bancos públicos está sendo estudada, para identificação de novos biomarcadores para uma doença genética rara. Para garantir e validar correta e eficientemente a descoberta desses biomarcadores, deve-se

Uma análise genômica de dados de sequências de RNA de humanos disponíveis em bancos públicos está sendo estudada, com o objetivo de identificar padrões de expressão gênica diferencial entre amostras de pacientes com uma doença específica e controles saudáveis. Garante a robustez e a precisão dos resultados

Uma análise genômica de dados obtidos de bancos públicos de sequências de DNA de humanos para identificar variantes associadas a uma doença rara está sendo conduzida. Os dados incluem variantes genéticas de diferentes populações e anotações funcionais de genes. Assinale a alternativa que apresenta a abordagem correta para identificar variantes potencialmente patogênicas e avaliar sua relevância clínica.

Um grupo de pesquisa está envolvido no sequenciamento do genoma de uma planta rara, obtendo dados de sequenciamento de uma plataforma de leitura curta (Illumina) e de uma plataforma de leitura longa (PacBio). Ao montar o genoma, enfrenta dificuldades para resolver regiões altamente repetitivas e estruturalmente complexas. A estratégia que superará esses desafios e obterá uma montagem genômica de alta qualidade é: