Mapas de potencial de Coulomb obtidos por criomicroscopia eletrônica podem revelar detalhes sobre o estado de carga das cadeias laterais de aminoácidos com grupos ionizáveis. Isso se deve a fatores de espalhamento distintos para elétrons em átomos neutros e ionizados na faixa de baixa resolução, o que pode resultar em dois tipos de densidades diferentes ao redor de resíduos ácidos e, portanto, interpretações sobre seu estado de protonação. Com base nessa afirmação, assinale a alternativa que melhor explica como a influência da carga negativa em átomos, por exemplo, o oxigênio, pode afetar a interpretação de mapas de potencial de Coulomb e o dano por radiação em criomicroscopia eletrônica.

Após a utilização de programas para o processamento de micrografias adquiridas em um criomicroscópio de transmissão, um especialista na área deve ser capaz de estimar, por simples inspeção visual das densidades do mapa de potencial de Coulomb, sua resolução aproximada. Com base nas características observadas nos mapas de 1 a 4, apresentados a seguir, e em seu conhecimento sobre a estrutura de proteínas, assinale a alternativa que contém a estimativa de resolução que mais se aproxima da resolução predita pela correlação de Fourier.

Na função de transferência de contraste, fatores como o coeficiente de aberração esférica da lente objetiva, as frequências espaciais, o comprimento de onda do elétron e a desfocalização da imagem influenciam a quantidade de contraste transmitida para a formação da imagem. Se a meta de um pesquisador for a determinação estrutural de uma macromolécula proteica com resolução próxima da atômica, entre 2 e 3 Å, qual das afirmações a seguir ele deve levar em consideração para a aquisição automatizada de micrografias em um criomicroscópio de 300 kV?

A integração entre íons focalizados e o módulo correlativo de fluorescência oferece vantagens no preparo de criolamelas em microscópios eletrônicos, por exemplo, para facilitar a identificação de áreas de interesse e, com isso, a seleção precisa da região celular a ser desbastada. A proteína ilustrada a seguir é chamada de proteína fluorescente verde (do inglês, green fluorescent protein, GFP) e sua fluorescência facilita o processo de seleção da região a sofrer o desbaste.

Com base nos conhecimentos sobre a fluorescência da GFP e a formação de seu cromóforo no interior do barril β, indique a alternativa correta: 

Com relação aos conhecimentos em criomicroscopia eletrônica de transmissão e varredura, é correto afirmar:

Pesquisadores da instituição ‘A’ têm interesse na biologia estrutural de vírus e buscam caracterizar vírus da família Mimiviridae de ambientes como fossas vulcânicas, corais e derivados de petróleo. A meta dos pesquisadores é coletar informações em resolução atômica dos vírus no contexto de infecções, ou seja, no interior de células hospedeiras. Vírus dessa família despertam interesse devido à sua complexidade. Apresentam uma superfície icosaédrica, genomas de 1,2 Mb e tamanhos na faixa de 800 nm, sendo visíveis até mesmo por microscopia ótica. Além disso, sua superfície é coberta por uma densa camada de fibrilas. Outro grupo de pesquisadores, da Instituição ‘B’, têm interesse na resolução estrutural, em escala atômica, de proteínas com tamanho molecular entre 5-15 kD, quando complexadas a alvos farmacológicos de igual tamanho. Com base nessas informações, assinale a alternativa correta.

Transformadas de Fourier são operações matemáticas muito utilizadas no processamento de micrografias obtidas por criomicroscopia eletrônica. As imagens a seguir ilustram o resultado de uma operação de Fourier realizada em quatro micrografias coletadas de maneiras distintas em um criomicroscópio. Ao observar essas imagens, é correto afirmar:

A criomicroscopia eletrônica alcançou uma fase de amadurecimento na análise e processamento de dados para a determinação estrutural de macromoléculas. Diversos algoritmos e programas foram desenvolvidos e estão disponíveis para a comunidade científica. Assinale a alternativa que indica quais os programas que podem ser usados nas respectivas etapas de processamento e análise de partículas únicas: correção de movimentos das micrografias, estimativa de valores de desfoco, classificação 2D de partículas, refinamento 3D, estimativa de resolução local de mapas de potencial de Coulomb e sua visualização.

A anatomia de um criomicroscópio eletrônico é conhecida por sua complexidade, envolvendo uma série de sistemas de lentes eletromagnéticas dispostas de forma conjugada. A figura a seguir ilustra alguns componentes desse tipo de microscópio.

Com base nos conhecimentos sobre os princípios de funcionamento desse tipo de microscópio, assinale a alternativa correta.