Uma das primeiras providências do Marquês de Pombal, ao assumir o Ministério Real, foi nomear seu irmão, Francisco Xavier de Mendonça Furtado, para o comando das Armas do Pará e direção da Capitania do Maranhão e Grão-Pará. É nessa época que Macapá assiste à chegada de colonos oriundos das Ilhas dos Açores.

Como parte da estratégia de expansão e colonização das posses portuguesas no Novo Mundo, o governo luso promove uma ampla campanha de remanejamento em Cabo Verde e Açores, que vai culminar com o envio de centenas de famílias ao Brasil. Assim é que chegam, em Macapá, os açorianos, entre 1730 e 1750.

Mas as dependências e imposições geográficas do povoado, assim como a malária e outros males tropicais, além da inadaptabilidade dos açorianos, aliada aos constantes desentendimentos entre o jesuíta Miguel Ângelo e o coronel Livramento, apesar de não terem se adaptado ao clima e à insalubridade da região.

O município de Mazagão teve origem na fundação de uma vila, pelo tenente-coronel Inácio de Alencar Moraes Sarmento, em cumprimento às ordens da Coroa portuguesa, que necessitava abrigar 163 famílias de colonos portugueses cristãos, se desentendiam com os mouros há muito tempo.

Os mouros passaram a reprimir quem não se adaptasse às leis islâmicas, fato do qual resultaram inúmeros conflitos. Os desentendimentos culminaram com a saída dos cristãos da região, que se fixaram em Macapá, por volta de 1771.