Foi instituído por comando direto de Pedro li, tendo como principal objetivo constituir uma base do governo central para controlar revoltas e rebeliões separatistas contra o Império.

Foi criado em 1943 durante o governo de Getúlio Vargas. O território era controlado pelo governo federal com objetivos geopolíticos, econômicos e militares.

O Território Federal do Amapá foi criado com a Constituição de 1988, dando autonomia para a região constituir um governo de estado.

Foi criado durante o período ditatorial civil-militar (1964-1985), visando a um controle maior da região quanto a ameaças internas e externas ao regime.

Esse Território Federal foi constituído em 1890, logo após a instituição da República do Brasil, visando solidificar o controle republicano na região amazônica.