Gestão dos sistemas municipais nos municípios habilitados.

Implementação de políticas de integração das ações de saneamento às de saúde.

Execução de operações complexas voltadas ao controle de doenças que possam se beneficiar da economia de escala.

Apoio logístico e estratégico às atividades de atenção à saúde das populações indígenas, na conformidade de critérios estabelecidos pela CIT.

Formulação e execução da política de sangue e hemoterapia, de acordo com a política nacional.