O protocolo IKE (Internet key exchange), método padrão para utilização no IPSec, trabalha com o objetivo de ser um protocolo geral de troca de chaves e é executado na camada de aplicação da arquitetura TCP/IP.

Uma vez iniciado em um runlevel, o sistema não pode mudar de runlevel enquanto estiver no ar (on-the-fly), podendo fazêlo apenas após reiniciação completa do sistema e nova recarga do kernel na memória.

Em algumas distribuições, dentro do diretório /etc/rc.d/ são encontrados os diretórios rc.sysinit e init.d. No primeiro, são disponibilizados scripts executados durante a iniciação do sistema. No segundo, há scripts para iniciação de serviços do sistema, tais como o gerenciador pcmcia e o servidor http. Estes scripts podem ser executados mesmo depois de o sistema estar completamente iniciado, sob demanda de um usuário com privilégios suficientes.

A iniciação pode ser realizada nos níveis de execução (runlevel), entre os quais o runlevel 0 e o runlevel 6 caracterizam-se por serem monousuários, utilizados para a manutenção do sistema.

O tamanho das páginas de memória em Linux e em Windows 2000 independe da plataforma de processamento para a qual o sistema foi compilado. Desse modo, por motivos de ajuste fino de desempenho, os dois sistemas operacionais utilizam páginas de tamanhos diferentes, sendo as páginas do Windows maiores que as páginas usadas no Linux.

Como os sistemas Linux e Windows 2000 possuem uma arquitetura de microkernel, o gerenciamento de memória em ambos os sistemas reside fora do kernel, nas formas de um subsistema do executivo, no caso do Windows 2000, e de um serviço que executa em modo privilegiado, no caso do Linux.

Recursos em uma partição NTFS têm atributos associados às permissões de compartilhamento, para uso em compartilhamento de arquivos por meio dos serviços de compartilhamento proprietários do Windows®. EXT2 e EXT3 também possuem um serviço de compartilhamento nativo baseado em NFS e denominado samba.

O controle de acesso a arquivos e diretórios em partições NTFS utiliza uma estrutura de objetos que possibilita atribuições de níveis complexos de permissão a cada arquivo ou parte da árvore de arquivos no sistema. Já o controle de acesso a arquivos e diretórios em partições EXT2 e EXT3 utiliza uma estrutura hierárquica, na qual, para cada objeto, apenas três níveis de permissões podem ser atribuídos: usuário proprietário, grupo e todos os usuários.

A memória virtual no Windows 2000 tem tamanho variável, pois é alocada em um arquivo que pode ter seu tamanho aumentado ou diminuído dinamicamente. No entanto, no Linux, a memória virtual tem tamanho fixo, já que é alocada em uma partição do disco rígido especialmente formatada para essa finalidade.

Os logs em sistemas Windows 2000 são divididos em 3 categorias: log de sistema (gerado pelo sistema operacional), log de segurança (gerado pelo sistema de auditoria configurável) e log de aplicativos (gerado pelos aplicativos em execução).