O flúor age aumentando o do pH crítico. Na presença de flúor o pH crítico do esmalte aumenta de 4,5 para 5,5, não permitindo a saída de cálcio/fosfato do fluido do biofilme e com isso ele aumenta a concentração de mineral no ecossistema e assim reduz a velocidade da perda mineral, e aumenta a eficiência na redeposição mineral.

O flúor age aumentando a produção de ácidos, pois atua na enolase da via glicolítica bem como na glicosiltransferase, que influencia na produção dos polissacarídeos extracelulares.

Aumento na resistência bactérias cariogênicas aos ácidos, por participar na ATPase, uma enzima importante para bactérias que vivem no meio ácido (acidúricas).

O fluoreto dinamicamente importante é aquele presente constantemente na cavidade bucal, participando do processo da cárie, atuando diretamente nos fenômenos da DES-RE

O flúor tem mais efeito quando ingerido de forma sistêmica pois passa a ser incorporado na matriz do esmalte tornando-o mais resistente as bactétias cariogênicas.