Com relação ao sequenciamento de genoma, analise as afirmativas abaixo:

I. No pirossequenciamento, ocorre a amplificação do DNA por PCR em emulsão, e a incorporação de cada nucleotídeo acarreta a liberação de pirofosfato.

II. O sequenciador Illumina/Solexa utiliza a técnica de sequenciamento por síntese, em que um nucleotídeo é incorporado por vez, em uma reação catalizada pelo DNA polimerase fixada em uma nanoesfera.

III. O formato padrão dos arquivos produzidos pelo sequenciador SOLID foi nomeado Standard Flowgram File (SFF) e pode conter dados de uma ou várias sequências.

IV. A partir de um genoma de referência, pode-se mapear as sequências produzidas pelas novas tecnologias de sequenciamento e agrupá-las conforme sua posição relativa, e, a partir desse mapeamento, identificar polimorfismos responsáveis pela manifestação de doenças.

Está CORRETO o que se afirma apenas em:

Considerando o alinhamento de uma sequência nucleotídica desconhecida em relação a um banco de dados, analise as afirmativas abaixo:

I. No resultado de alinhamento, por meio do programa BLAST, o E-value corresponde ao inverso da probabilidade resultante de um alinhamento que seja obtido ao acaso com uma sequência do banco de dados.

II. Duas sequências similares e com a mesma função são ditas homólogas e não têm ancestral comum.

III. Parálogos são genes que possuem a mesma função na mesma espécie, em consequência de fenômenos de duplicação gênica.

IV. Ortólogos são genes que possuem funções diferentes em espécies diferentes.

Está CORRETO o que se afirma apenas em:

No que diz respeito ao alinhamento múltiplo de sequências, analise as afirmativas abaixo:

I. O alinhamento múltiplo de sequências é bastante utilizado para obtenção das estruturas terciárias das proteínas que o compõem.

II. O CLUSTALW é uma das ferramentas heurísticas mais comuns para alinhamento múltiplo de sequências.

III. Os métodos progressivos de alinhamento múltiplo de n sequências possibilitam calcular, na última fase, o alinhamento de todos os possíveis pares de sequências.

IV. A análise filogenética usa geralmente o alinhamento múltiplo de sequências.

Está CORRETO o que se afirma apenas em:

Com relação aos bancos de dados genômicos, leia as afirmativas abaixo, atribuindo V para as verdadeiras e F para as falsas:

( ) O formato FASTA é composto por uma linha de comentário iniciada por “>”; pela sequência biológica; e por um “*” opcional, que marca o final da sequência.

( ) O MSS (multiple sequence standard) é um formato comum para alinhamentos múltiplos de sequências.

( ) O NCBI (National Center for Biotechnology Information) mantém o GenBank, que é uma coleção anotada de sequências de DNA disponíveis publicamente.

( ) A base de dados nr é mantida pelo NCBI e sua sigla significa New and Representative.

A sequência CORRETA é:

Leia as afirmativas abaixo, referentes à bioinformática e à biologia computacional, atribuindo V para as verdadeiras e F para as falsas:

( ) A bioinformática pode ser definida como uma área multidisciplinar que envolve principalmente a Biologia, a Ciência da Computação, a Matemática e a Estatística.

( ) Enquanto a biologia computacional trata de ferramentas para a organização e a recuperação de informações biológicas, a bioinformática está relacionada ao desenvolvimento de algoritmos.

( ) A biologia computacional é um campo de pesquisa muito próximo ao da bioinformática.

A sequência CORRETA é:

Leia as afirmativas abaixo sobre anotação genômica:

I. Uma forma comum de se realizar a anotação de proteínas é procurar similaridades das sequências com proteínas presentes em diferentes bancos de dados, utilizando ferramentas de alinhamento local como o BLASTp ou PSI-BLAST.

II. Para a busca de domínios funcionais de proteínas, têm sido usadas bases de dados como PFAM, PRINTS, PROSITE, ProDom, SMART e BLOCKS.

III. Na anotação genômica, o que é normalmente feito é a classificação das proteínas preditas com base em domínios funcionais, configurações espaciais e presença de padrões conservados, além de pesquisa ampla de similaridade contra proteínas bem caracterizadas.

Está CORRETO o que se afirma em:

Sobre a montagem de genomas e transcriptomas, é INCORRETO afirmar que:

Ao rodar o aplicativo BLAST com uma nova e não identificada sequência de proteína, o E-value do primeiro match deu 0.0. Marque a alternativa que apresenta CORRETAMENTE o que isso significa:

Sobre os bancos de dados genômicos, é INCORRETO afirmar que:

Sobre os maiores bancos de dados (databases) em genômica, é INCORRETO afirmar que: