Das etnias indígenas dessa região, foram os Mongoyóos que se associaram a João Gonçalves da Costa.

Além dos confrontos diretos, os portugueses utilizaram como estratégia o oferecimento de roupas infectadas com o vírus da varicela aos índios.

Foi Francisco de Chaves o responsável pela instauração do primeiro conflito contra os indígenas da região.

Durante um dos confrontos contra os nativos, os portugueses prometeram construir uma capela a Nossa Senhora dos Milagres caso saíssem vitoriosos.

Os índios vítimas dos massacres foram os guaranis e os kaingangs, cujo os aldeamentos se espalhavam pelo Sertão da Ressaca.