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3686082 Ano: 2025
Disciplina: Biologia
Banca: FUVEST
Orgão: USP

AlphaFold2 e suas aplicações nos campos da biologia e medicina

Em dezembro de 2020, o AlphaFold2 (AF2), um modelo baseado em aprendizado de máquina (machine learning) para prever estruturas de proteínas desenvolvido pela DeepMind, conquistou o campeonato na 14ª edição do Critical Assessment of Structure Prediction (CASP14). Um ano e meio depois, a DeepMind e o EMBL’s European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) divulgaram as estruturas de mais de 200 milhões de proteínas previstas pelo AF2, que cobrem quase todas as proteínas conhecidas no planeta (o universo das proteínas). Esses dois eventos atraíram grande atenção para o AF2 na comunidade científica. O AF2 representa um avanço marco na previsão de estruturas de proteínas. Ele é considerado a maior contribuição da Inteligência Artificial (IA) para o campo científico e um dos maiores avanços científicos feitos pela humanidade no século XXI. Este é um feito histórico notável no entendimento humano da natureza. A alta avaliação do AF2 não é excessiva, pois entender as estruturas tridimensionais (3D) das proteínas é um dos problemas mais desafiadores no campo da biologia, que tem desconcertado os cientistas por 50 anos. Embora múltiplas tecnologias, incluindo Ressonância Magnética Nuclear (RMN), Cristalografia por Raios-X e Microscopia Crioeletrônica (cryoEM), tenham sido adotadas para resolver as estruturas das proteínas, apenas cerca de 200.000 estruturas de proteínas foram determinadas, cobrindo menos de 0,1% do universo das proteínas.

Adaptado de Yang, Z. et al. (2023). AlphaFold2 and its applications in the fields of biology and medicine. Sig Transduct Target. Tradução livre.

A predição de interações proteína-proteína por métodos de aprendizado de máquina se dá pela
 

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3686081 Ano: 2025
Disciplina: Biologia
Banca: FUVEST
Orgão: USP

AlphaFold2 e suas aplicações nos campos da biologia e medicina

Em dezembro de 2020, o AlphaFold2 (AF2), um modelo baseado em aprendizado de máquina (machine learning) para prever estruturas de proteínas desenvolvido pela DeepMind, conquistou o campeonato na 14ª edição do Critical Assessment of Structure Prediction (CASP14). Um ano e meio depois, a DeepMind e o EMBL’s European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) divulgaram as estruturas de mais de 200 milhões de proteínas previstas pelo AF2, que cobrem quase todas as proteínas conhecidas no planeta (o universo das proteínas). Esses dois eventos atraíram grande atenção para o AF2 na comunidade científica. O AF2 representa um avanço marco na previsão de estruturas de proteínas. Ele é considerado a maior contribuição da Inteligência Artificial (IA) para o campo científico e um dos maiores avanços científicos feitos pela humanidade no século XXI. Este é um feito histórico notável no entendimento humano da natureza. A alta avaliação do AF2 não é excessiva, pois entender as estruturas tridimensionais (3D) das proteínas é um dos problemas mais desafiadores no campo da biologia, que tem desconcertado os cientistas por 50 anos. Embora múltiplas tecnologias, incluindo Ressonância Magnética Nuclear (RMN), Cristalografia por Raios-X e Microscopia Crioeletrônica (cryoEM), tenham sido adotadas para resolver as estruturas das proteínas, apenas cerca de 200.000 estruturas de proteínas foram determinadas, cobrindo menos de 0,1% do universo das proteínas.

Adaptado de Yang, Z. et al. (2023). AlphaFold2 and its applications in the fields of biology and medicine. Sig Transduct Target. Tradução livre.

Assinale a alternativa que descreve a principal vantagem no uso da aprendizagem de máquina na predição de estruturas biomoleculares.
 

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3686080 Ano: 2025
Disciplina: Biologia
Banca: FUVEST
Orgão: USP

A estrutura terciária de uma proteína descreve a conformação tridimensional de toda a cadeia polipeptídica, resultante das interações entre os seus átomos e resíduos. Essas interações são fundamentais para a função biológica da proteína.

Considerando as características da estrutura terciária das proteínas, assinale a alternativa correta.

 

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3686079 Ano: 2025
Disciplina: Biologia
Banca: FUVEST
Orgão: USP
A estrutura primária de uma proteína corresponde à sua sequência linear de aminoácidos, essa sequência é influenciada por diversos fatores que afetam a estabilidade e a função da proteína. Considerando as características da estrutura primária das proteínas, assinale a alternativa correta.
 

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3686078 Ano: 2025
Disciplina: Biologia
Banca: FUVEST
Orgão: USP

Assinale a alternativa que apresenta corretamente a estrutura secundária de uma proteína.

 

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3686077 Ano: 2025
Disciplina: Biologia
Banca: FUVEST
Orgão: USP
A estrutura quaternária das proteínas descreve a organização espacial de múltiplas cadeias polipeptídicas (subunidades) que interagem entre si para formar uma proteína funcional. Considerando as características da estrutura quaternária das proteínas, assinale a alternativa correta.
 

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3686076 Ano: 2025
Disciplina: Biologia
Banca: FUVEST
Orgão: USP
A estrutura secundária das proteínas refere-se ao arranjo local das cadeias polipeptídicas, que se formam por interações específicas entre os átomos do esqueleto da cadeia principal. Considerando as características e os tipos de estruturas secundárias das proteínas, assinale a alternativa correta.
 

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3686075 Ano: 2025
Disciplina: Biologia
Banca: FUVEST
Orgão: USP
Considerando o papel das interações hidrofóbicas no processo de dobramento de proteínas, assinale a alternativa correta.
 

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Sobre o preparo de amostras em proteômica bottom-up (identificação de proteínas baseado na digestão proteolítica das amostras), assinale a alternativa correta.
 

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3685874 Ano: 2025
Disciplina: Biologia
Banca: FUVEST
Orgão: USP
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Para a recomposição florestal de um bosque ou floresta urbana, qual combinação de tipos de árvores com relação ao seu comportamento sucessional e afinidade com a luz é a mais barata e eficiente para obter uma floresta com mais riqueza e diversidade?
 

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