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Respondida
Na metabolômica, as abordagens direcionada (targeted) e
não-direcionada (untargeted) diferem em termos de objetivos
analíticos, instrumentação empregada e estratégias de
processamento de dados. Qual das alternativas a seguir
descreve as principais diferenças entre as abordagens
targeted e untargeted, incluindo instrumentação utilizada e
estratégias de processamento de dados?
Respondida
Sobre o preparo de amostras em proteômica bottom-up
(identificação de proteínas baseado na digestão proteolítica
das amostras), assinale a alternativa correta.
A
O protocolo de extração em fase sólida com colunas C18
após a digestão segue a ordem: 1) condicionamento da
coluna, 2) adição da amostra, 3) lavagem com 100%
solvente orgânico (acetonitrila ou metanol), e 4) eluição da
amostra em solução aquosa acidificada.
B
A utilização de ditiotreitol (DTT), um agente redutor, tem o
papel de prevenir a oxidação de aminoácidos suscetíveis,
tais como a metionina.
C
A reprodutibilidade das análises depende de uma
digestão completa, e, atualmente, a enzima tripsina (que
perde sua atividade em pH<4) tem sido amplamente
substituída pela pepsina, pois, nesse caso, a digestão já é
realizada em pH ácido compatível com a posterior injeção
no espectrômetro de massas dos peptídeos resultantes.
D
Desnaturantes caotrópicos, como a ureia, ou detergentes,
como o dodecil-sulfato de sódio (SDS), são utilizados para
solubilizar e desnaturar proteínas. A vantagem da
utilização de ureia é que a enzima tripsina tolera altas
concentrações (até 8 M) desse agente e, dessa forma,
pode-se injetar o material digerido diretamente no
espectrômetro de massas, evitando-se o passo adicional
para remover detergentes.
E
Surfactantes estão comumente presentes nos tampões
utilizados para a extração das proteínas dos tecidos, mas
são incompatíveis com a análise por espectrometria de
massas. Dispositivos como filtros de limite de peso
molecular, filtros contendo membrana de borosilicato e
micropartículas que imobilizam as proteínas por
agregação têm sido utilizados para remover
contaminantes indesejados.
Respondida
Com relação a análises de metabólitos por espectrometria de
massas, assinale a alternativa correta.
Respondida
Em relação à utilização de espectrometria de massas para a
elucidação estrutural de uma molécula, é correto afirmar:
Respondida
Sobre modos de identificação e quantificação por
espectrometria de massas, é correto afirmar:
A
No método de aquisição dependente de dados (do inglês,
DDA), o instrumento alterna entre um espectro de varredura
dos íons precursores que coeluem naquele tempo
cromatográfico e a aquisição de espectros de
fragmentação, onde o maior número possível de íons
precursores é sequencialmente isolado e fragmentado.
B
No método de aquisição independente de dados (do inglês,
DIA), todos os íons precursores em uma janela de m/z
predeterminada são fragmentados ao mesmo tempo, o que
leva a espectros de fragmentação (MS/MS) complexos,
gerando muitos valores faltantes nas análises de dados.
C
Uma desvantagem do método de DIA em relação ao
método de DDA é a necessidade do conhecimento prévio
dos analitos de interesse. Entretanto, uma grande vantagem
é a maior precisão na quantificação dos analitos.
D
O conhecimento prévio de uma lista de transições, incluindo
íons precursores, bem como de seus fragmentos
correspondentes é essencial para definir um experimento
de quantificação direcionada (alvo, targeted, comumente
chamado de monitoramento de reações em paralelo, do
inglês, PRM) em instrumentos híbridos de alta resolução, tais
como Q-TOF e Q-orbitrap.
E
Uma desvantagem de experimentos de quantificação
direcionada (alvo, comumente chamado de monitoramento
de reações em paralelo, do inglês, PRM) em relação a
experimentos não direcionados é que existe a perda de
sensibilidade devido aos passos sucessivos de filtro de
massas (um para íons precursores e o outro para
fragmentos).
Respondida
Em relação a técnicas de separação acopladas à
espectrometria de massas, assinale a alternativa correta.
A
A cromatografia em fase gasosa é comumente utilizada
acoplada ao espectrômetro de massas para deteção de
metabólitos. Como muitos metabólitos possuem baixo ponto de ebulição, é necessária uma etapa de derivatização para
diminuir a sua volatilidade e permitir que possam ser
analisados por GC-MS.
B
Na cromatografia líquida de alta eficiência utilizando fase
reversa, os analitos hidrofóbicos eluem primeiro da coluna
cromatográfica, seguidos por compostos polares e muito
hidrofílicos.
C
Para a separação de compostos apolares, tais como
lipídeos, utiliza-se comumente a técnica de cromatografia
líquida de interação hidrofílica (HILIC), que é uma variação
da antiga cromatografia de fase normal, que utilizava sílica
como fase estacionária.
D
A utilização de espectrômetros de massas de alta resolução
e acurácia tornou rotineira a análise direta de misturas de
analitos sem uma etapa anterior de separação, uma vez que
essa metodologia é rápida, de alta repetibilidade e com
capacidade de identificar múltiplos isômeros em uma única
análise.
E
A separação de um (ou mais) composto(s) de interesse de
outros analitos presentes em matrizes complexas pode ser
realizada por cromatografia multidimensional, em que uma
ou mais etapas de separação cromatográfica diferentes são
realizadas antes da análise por espectrometria de massas
(offline), ou acopladas sequencialmente à deteção pelo
espectrômetro de massas (online). Uma desvantagem da
cromatografia multidimensional online é o maior tempo
ocioso do espectrômetro de massas.
Respondida
Sobre um espectrômetro de massas do tipo triplo quadrupolo
(Q1Q2Q3), é correto afirmar:
A
Em uma varredura de íons produtos, todos os íons que
produzem um íon fragmento específico são determinados.
B
Em uma varredura de íons precursores, os íons produtos
resultantes da fragmentação de um determinado precursor
são determinados.
C
Na varredura de perda neutra, os íons são monitorados em
todo o intervalo de m/z, pelo primeiro (Q1) e terceiro (Q3)
quadrupolos, mas Q3 monitora os íons com um
deslocamento de massa constante em relação ao
monitoramento em Q1. Esse deslocamento corresponde à
perda de um fragmento neutro do íon precursor.
D
No monitoramento de reação selecionada (do inglês, SRM
ou também conhecido pela abreviatura MRM), o primeiro
quadrupolo (Q1) filtra precursores de um determinado m/z.
Após a colisão com um gás inerte que ocorre no segundo
quadrupolo (Q2), todos os fragmentos são analisados
simultaneamente no terceiro quadrupolo (Q3).
E
Em um instrumento do tipo triplo quadrupolo, o segundo
quadrupolo (Q2) é versátil e possui várias funções,
podendo ser usado como célula de colisão, para análise
de íons precursores e análise de íons produtos.
Respondida
Uma análise por espectrometria de massas possui quatro
componentes fundamentais, um sistema para introdução de
amostra, uma fonte de íons, um analisador de massas e um
detector. Sobre esse assunto, é correto afirmar:
Respondida
Em relação a analisadores de massas e suas características,
é correto afirmar:
Respondida
Com relação aos métodos de ionização aplicados a
biomoléculas, é correto afirmar:
A
No geral, íons Na+ precisam ser removidos das amostras,
pois atrapalham a ionização por eletrospray. Entretanto,
alguns métodos utilizam acetato de sódio para melhorar a
ionização de lipídeos, carboidratos e outros compostos de
difícil ionização, uma vez que esse sal favorece a formação
de adutos de carga positiva, facilitando a detecção.
B
Para a ionização no modo negativo utilizando-se a técnica
de eletrospray, uma mistura de solventes comumente
empregada é tampão tris (Tris(hidroximetil)aminometano,
10 mM, pH 9, em água) e metanol, pois o tampão tris é
básico e facilita a desprotonação, enquanto que o metanol
auxilia na rápida evaporação para favorecer a ionização.
C
Na ionização no modo eletrospray, a sensibilidade da
técnica pode ser aumentada ao se aumentar o diâmetro do
capilar utilizado e o fluxo de solvente direcionado para o
espectrômetro de massas.
D
Na ionização do tipo MALDI (ionização por dessorção a
laser assistida por matriz), a amostra é irradiada com um
laser de comprimento de onda na região do UV, que
fornece a energia absorvida pela amostra, facilitando sua
dessorção da matriz e ionização.
E
A ionização do tipo MALDI (ionização por dessorção a
laser assistida por matriz) é muito utilizada para o
rastreamento inicial de pequenos metabólitos (massa
molecular < 300 Da) em amostras biológicas, pois permite
a análise rápida de amostras contendo vários analitos sem
separação cromatográfica.