Deve-se incluir controles positivos e negativos em cada reação imuno-histoquímica.

De um modo geral, a imunomarcação é somente de intensidade forte a muito forte.

A preparação tecidual consiste, sequencialmente, em fixação, desidratação e inclusão em parafina.

Os fixadores coagulantes, como o álcool, e aqueles de ligação cruzada, como o formaldeído, podem causar alterações na configuração de proteínas, mascarando os determinantes antigênicos e, consequentemente, afetando a ligação do anticorpo.

O pH e a composição química das soluções usadas para recuperação antigênica não são importantes na reação imuno-histoquímica.

O tempo de incubação depende da sensibilidade e concentração do anticorpo primário, bem como da qualidade do tecido.

A incubação das lâminas em uma câmara úmida é aconselhável em qualquer temperatura, pois, se uma lâmina tratada com o anticorpo primário ficar seca, tem-se como resultado uma coloração de fundo.

A remoção incompleta de parafina não representa uma causa de coloração de fundo.

A silanização das lâminas é uma forma de preparo das lâminas antes dos cortes serem submetidos à técnica imuno-histoquímica.

A contracoloração com eosina é frequentemente utilizada na técnica imuno-histoquímica.